截至3月17日13：00，全州无新增确诊病例，无新增疑似病例。
全州累计报告确诊病例1例（已治愈出院并隔离期满），累计报告疑似病例12例，已全部排除。
州疾控中心累计收到检测留观病例标本358份，除确诊病例郭某检测结果为阳性外，其余检测结果均为阴性。全州新冠肺炎疫情发病率：0.106/10万。
全州目前共设置卫生服务站点57个，今日出动卫生人员398人，消毒车辆7337辆次，开展常规体温监测22199人次。医疗机构、留观场所等重点地区消杀面积累计达到4246.35万平方米。全面推广“讯阿坝”疫情防控卡点信息登记，截至3月16日，“讯阿坝”系统已累计登记车辆25619辆、累计登记人数75730人，利用系统登记后过关车辆20128辆、人数49273人。
3月16日，全州各县（市）恢复40辆市际班车、26辆县际班车、17辆公交车，226辆出租车、236辆农村客运车辆运行。恢复运行车辆均执行了疫情防控措施。
全州排查州公安局共享的2月15日至3月13日阿坝州籍境外回流人员信息共139人，其中14人不是阿坝州户籍已排除；102人目前不在阿坝州境内；19人已返回阿坝州（2人已隔离期满，17人正在进行居家隔离）；4人无法联系。
全州14个州县定点医院设置发热门诊，3月16日0-24时，全州医疗机构发热门诊共接诊28人、新增留观0人，现有留观人员0人，累计共接诊2715人、留观226人。
全州共设置集中观察点43个，集中隔离房间863间，集中留观11人，居家隔离657人，均无异常情况；累计解除集中留观625人，累计解除居家隔离15881人。
全州共有231个基层医疗卫生机构开展外出务工人员健康服务工作。截至3月16日18:00，累计为外出务工人员办理申报健康证明97461人份，其中省内85850人份，省外11611人份。持续开展农民工返岗“春风行动”，自启动“春风行动”以来，已安全运送农民工76车1536人。
全州加大医废处置工作，3月16日，茂县医疗废物集中处置点处置医废0.605吨，累计处置36.67吨。